Creation Rebirth é um jutsu criado por Tsunade com o objetivo de conseguir proteger seus companheiros. Ele é considerado o maior jutsu de regeneração existente no mundo ninja, permitindo que o usuário fique imortal enquanto a habilidade estiver ativada.

O Creation Rebirth faz com que uma grande quantidade de chakra de uma vez, forçando uma estimulação nas células. Com isso, qualquer ferimento ou órgão destruído ele é instantaneamente regenerado, tornando impossível que Tsunade morra enquanto tiver chakra.

Tengai Shinsei é um jutsu utilizado por Madara durante a guerra e foi responsável por causar uma destruição massiva. A habilidade faz com que um gigantesco meteoro vai até a direção escolhida pelo usuário, resultando em uma explosão.

Caso alguém consiga parar o meteoro, Madara ainda pode invocar um segundo para colidir com o anterior, fazendo com que a explosão aconteça. No anime o Susanoo e o próprio corpo do vilão também foram afetados pelo seu próprio jutsu.

O Susanoo é um dos vários jutsus que são somente do clã Uchiha e só pode ser utilizado pelos usuários do Mangekyou Sharingan. O Susanoo é uma gigantesca criação de chakra humanoide que serve tanto para a ofensiva quanto para defensiva.

Cada Uchiha tem seu próprio Susanoo com suas diferenças visuais e de poder. O de Sasuke o personagem consegue combinar a criatura com seu Amaterasu e invocar partes menores dele para sua proteção. O de Kakashi usa shurikens que permitem teleportar no local que ela entrar em contato.

O Edo Tensei é um dos vários jutsus proibidos no mundo de Naruto, e foi criado por Tobirama Senju. Ela permite reviver uma pessoa em seu último momento de vida utilizando um outro corpo. A habilidade foi mostrada pela primeira vez no anime clássico onde Orochimaru utilizou na batalha contra o terceiro hokage.

Mas o Edo Tensei só foi utilizado de forma perfeita por Kabuto durante a guerra, onde o personagem foi capaz de reviver uma infinidade de personagens. Entre eles antigos membros da Akatsuki, como Itachi e Nagato, personagens queridos como Asuma e até mesmo Madara.

No mundo de Naruto diversos ninjas utilizam habilidades a distância ou Genjutsu para enfrentar seus adversários. Mas alguns se especializaram somente nos combate corpo a corpo, quase não utilizando nenhum tipo de jutsu. Para isso, ninjas como Might Guy utilizam os Oito Portões, para quebrar os limites de seu corpo.

Cada um dos oitos portões ao serem abertos concede mais força, velocidade e novas habilidades em detrimento do próprio corpo. Ao abrir todos os oito, o ninja se torna mais poderoso que os Kages, mas irá resultar em sua própria morte ao fim do jutsu. Guy utilizou os oito portões para enfrentar Madara, conseguindo causar ferimento no vilão.

O principal jutsu de Naruto é o seu Rasengan que o personagem vai aprimorando durante sua jornada. Durante a guerra, o personagem recebe o Chakra do Eremita dos Seis Caminhos se tornando ainda mais poderoso e aprimorando suas habilidades.

Com o chakra do Eremita Naruto é capaz de utilizar o Seis Caminhos: Super Rasenshuriken Gigante. Para usar o jutsu, o protagonista combina seu rasenshuriken com uma esfera negra do chakra do Eremita, para causar uma gigantesca explosão em seu inimigo.

A Flecha de Indra é o jutsu mais poderoso de Sasuke e só foi possível ser utilizado após o ninja absorver o chakra das Bestas de Caudas. A habilidade é uma gigantesca flecha elétrica lançada da forma completa de seu Susanoo, capaz de derrotar inimigos somente com um acerto.

Sasuke utilizou a habilidade durante sua batalha final contra Naruto, rivalizando com o Seis Caminhos: Super Rasenshuriken Gigante do protagonista. Após os eventos que finalizam Naruto Shippuden, o ninja nunca mais usou o jutsu.

O Shinra Tensei é uma das habilidades mais poderosas utilizadas por Pain durante sua batalha contra Naruto. O jutsu cria uma força repulsiva em volta do usuário que é capaz de afastar qualquer pessoa e também alguns ataques, como o Amaterasu. O tamanho do Shinra Tensei é definido pela quantia de chakra utilizada pelo usuário.

Quando Pain está em Konoha o vilão utiliza uma quantidade gigantesca de chakra para o Shinra Tensei, reduzindo boa parte da vila a uma cratera. O único lado negativo do jutsu é que após utilizado o ninja precisa esperar um pouco antes de um novo uso, seja alguns segundo ou minutos, dependendo do nível de força que o Shinra Tensei foi utilizado.

O Kotoamatsukami é um genjutsu extremamente poderoso que somente o Mangekyou Sharingan de Shisui era capaz de utilizar. O jutsu permite manipular ou adicionar falsas memórias no alvo sem que ele perceba, sendo uma ótima ferramenta de manipulação.

Quando Shisui está prestes a morrer, ele dá seu olho para Itachi, já que o jutsu é muito perigoso. O ninja coloca o olho em um de seus corvos e utiliza o Kotoamatsukami durante a Quarta Guerra Ninja para se libertar do controle do Edo Tensei.

O Tsukuyomi infinito é o Genjutsu mais poderoso da franquia e é capaz de colocar todo o mundo em uma ilusão, prendendo cada um em seu próprio sonho. Além disso, o jutsu drena o chakra dos que foram afetados para fortalecer a Árvore Divina.

Somente uma pessoa com o acesso ao Rinne Sharingan é capaz de utilizar o jutsu e é necessário refletir seus olhos na lua, afetando todos que olharem para ela. A única forma de quebrar o genjutsu é a mistura do Rinnegan com o chakra das Bestas de Caudas.