A segunda temporada da série mostra um salto de cinco anos em relação aos eventos da primeira temporada da série.

De lá para cá, muita coisa aconteceu, novos heróis entraram para a equipe, Aqualad teve de lidar com a morte de sua amada Tula, mas acabou sucumbindo e se aliou ao Arraia Negra, seu pai, um descendente do Flash veio do futuro para avisá-lo de que ele seria morto, e é daí que começa nossa história.

A cena que provavelmente servirá de base para a terceira temporada da série mostra o traiçoeiro Vandal Savage se aliando a Darkseid para dar continuidade em seus planos.

Usando a nave de Mongul, Savage vai até Apokolipse e sela o acordo com um dos piores inimigos da Liga da Justiça, o que indica que teremos uma grande ameaça pela frente.

Despois de descobrirem que o Arqueiro Vermelho era na verdade um clone de Roy e que o verdadeiro poderia estar morto, finalmente vemos o desfecho desse arco.

Depois de concluir a missão de se infiltrar na Liga, o clone e Cheshire começaram a procurar pelo verdadeiro Roy e até mesmo se casaram e tiveram uma filha, depois de tanto procurarem, finalmente encontraram o verdadeiro, mas ele havia perdido um braço que foi usado como material genético para criar o clone.

Um dos eventos mais trágicos (e tristes) da temporada é sem dúvidas a morte de Wally West.

Em uma tentativa de dissipar o campo magnético colocado sob a terra pelos Besouros, Wally se juntou à Bart e Barry Allen em uma corrida até o polo-Norte, porém por ser mais lento do que os outros dois velocistas, acabou recebendo toda a energia enviada pelo casulo e isso fez com que ele se dissipasse junto com ela.

Todos ficaram devastados com isso, principalmente Ártemis, que havia ganhando um último beijo de Wally antes que ele partisse.

Depois da morte de Tula, Aqualad se revoltou e resolveu se juntar a seu pai, o vilão Arraia Negra, para provar que realmente havia mudado de lado, Aqualad matou Ártemis a sangue frio, porém tudo isso não passava de um plano para se infiltrar na organização A Luz.

Aqualad havia feito um acordo com Ártemis e Asa Noturna para simular a morte da arqueira que viveria sob o disfarce da vilã Tigresa e seria o braço direito de Aqualad quando ele passasse para o lado sombrio.

Um dos momentos mais legais dessa temporada é quando os novos membros da equipe entram na gruta do Monte da Justiça dedicada aos membros falecidos.

Os hologramas mostram Ártemis que havia sido supostamente assassinada por Aqualad, Tula, a atlante por quem Aqualad era apaixonado, o Robin Jason Todd, que morreu pelas mãos do Coringas, e um dos mais legais de todos, o Besouro Azul Ted Kord, que foi morto por Max Lord nos quadrinhos.

Quando o hiperativo neto de Barry Allen chega do futuro para avisá-lo de sua morte e do futuro pós-apocalíptico, temos um dos momentos mais icônicos de toda a série, a união de várias gerações de velocistas na mesma cena, podemos ver Joel Ciclone, Kid Flash, Flash e impulso correndo lado a lado para derrotar o vilão Neutron foi incrível!

Um dos momentos mais marcantes da temporada é sem dúvidas o seu encerramento, onde depois de tantas reviravoltas, os heróis finalmente são integrados à Liga da Justiça e finalmente ganham acesso à Torre de Vigilância, o gigantesco satélite que serve de base para os heróis.

O segredo de Aqualad deixou a equipe devastada e ele causou ódio profundo em todos os que não sabiam do plano quando ele simulou o assassinato de Ártemis.

Um dos membros mais poderosos da equipe é sem dúvidas a Miss Marte, e ela descarrega toda a sua raiva e decepção em Aqualad quando tem a oportunidade em um intenso ataque psíquico, porém, ao fazer isso, acaba descobrindo o segredo e que tudo não passou de uma encenação, entretanto era tarde demais, seu ataque acabou deixando Aqualad catatônico, e ela se arrependeu amargamente disso.

Um dos maiores plot twists dessa temporada é sem dúvidas a traição de Jaime Reyes, o Besouro Azul, porém sua traição não é feita de forma voluntária e sim por culpa do escaravelho acoplado em seu corpo que lhe concede os poderes.

O escaravelho faz parte de uma raça de alienígenas conquistadores que o enviaram para a Terra para fazer o reconhecimento do terreno, quando conseguem informações suficientes, eles invadem e conquistam o planeta, e são conhecidos como The Reach.