Aaron Davis (Donald Glover) menciona que ele tem um sobrinho. Nos quadrinhos, Aaron Davis é a versão do universo Ultimate Marvel do vilão Gatuno, seu sobrinho é Miles Morales, também conhecido como o segundo Ultimate Homem-Aranha.

Kenneth Choi (Principal Morita) também interpretou Howling Jim Morita em Capitão América: O Primeiro Vingador (2011). No escritório do diretor, você pode ver fotos do Howling em cima de um dos armários, o que sugere que são parentes, talvez seu neto?

Jennifer Connelly fez a voz da inteligência artificial do traje do Homem-Aranha, a Karen. Seu marido, Paul Bettany , interpretou o carismático computador do Homem de Ferro, JARVIS.

A placa de número de carro da tia May é AMF-1562. AMF faz referência aos quadrinhos Amazing Fantasy, 15 é o número da edição que Homem-Aranha foi criado e 62 é 1962, o ano em que o Homem-Aranha apareceu pela primeira vez.

Os gostos literários de Michelle (Zendaya) contêm alusões sutis à trama ou à aranhas. Em um ponto, ela é vista como lendo "Servidão humana" de W. Somerset Maugham. Nessa novela, o protagonista é um órfão morando com sua tia e tio. Mais tarde, ela está lendo "Convite para uma Decapitação" de Vladimir Nabokov. Que conta a história de um condenado aguarda sua execução, acompanhado apenas por uma aranha na sua cela. Finalmente, durante a cena do Monumento de Washington, ela está usando uma camiseta de Sylvia Plath. Plath escreveu um poema chamado "Aranha" e usou aranhas como imagens em outros poemas.

Quando Ned está conversando com Peter depois de descobrir que ele é Homem-Aranha, durante uma das suas aulas, podemos ouvir, ao fundo, o professor discutindo os Acordos de Sokovia. Foi o episódio que foi introduzido no Capitão América: Guerra Civil (2016), onde Tom Holland fez sua estreia como Homem-Aranha.

Quando Homem-Aranha está observando o roubo do caixa eletrônico do banco, na parede do prédio atrás dele, está pixada a palavra "Bagley" em letras grandes. Isto é em referência ao artista de quadrinhos O Espetacular Homem-Aranha e Ultimate Homem-Aranha Mark Bagley.

Embora Chris Hemsworth não estivesse no Capitão América: Guerra Civil (2016), Tom Holland atuou com ele no Coração do Mar (2015), fazendo de Mark Ruffalo o único Avenger original com quem Tom Holland nunca esteve em um filme.

No início do filme, quando Peter (Tom Holland) está com Tony Stark (Robert Downey, Jr.), na limusine, está usando uma camisa que diz: "A física é teórica. A diversão é real!" Esta é uma citação de The Big Bang Theory (2007), um show sobre pessoas incrivelmente inteligentes com habilidades sociais muito pobres, bem como Peter.

Na cena em que o Homem-Aranha está perseguindo os homens de Toomes na camionete branca, Homem-Aranha passa por uma festa na piscina onde Curtindo a Vida Adoidado está passando em uma TV de tela grande, especificamente a cena em que Ferris está correndo para casa. E quando Peter grita "Bom filme", foi porque o ator Tom Holland realmente assistiu e gostou.